根据1982年中国古生物学会常务理事会关于成立古脊椎动物专业委员会的指示，经过充分酝酿，成立了古脊椎动物专业委员会筹备组。筹备组由中国古生物学会副理事长周明镇负责，成员由郑家坚、胡长康、祁国琴、李凤麟、董枝明、王俊卿等六人组成。阎德发协助筹备组处理日常事务。 

1984年10月17日-24日，中国古脊椎动物学会在山东莱阳成立并召开第一届学术会议。选举产生第一届理事会。周明镇任理事长，张弥曼任副理事长，秘书长胡长康，副秘书长郑家坚、董枝明，常务理事周世武、李凤麟，名誉理事袁复礼、刘东生、贾兰坡、王存义。出席会议代表150余人，宣读论文52篇。会议期间代表们参观了1951年和1953年杨钟健、刘东生等发掘“青岛龙”的现场和层型剖面。 

1987年2月22日-27日，第2届学术年会由学会与江苏省古生物学会在苏州东山联合举办。来自全国21个省、市、自治区的76个单位的近200名代表参加了会议，大会收到论文近100篇，报告论文52篇，内容涉及地质、古生物、古气候、古环境、古地磁、分类学等众多领域。第二届理事会组成同第一届。 

1987年10月12日-26日在北京举行早期脊椎动物研究及与其有关的进化问题讨论会。会议由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国古生物学会、中国古脊椎动物学会共同主办。来自中国和美国、澳大利亚、加拿大等8个国家的四十余位代表参加了室内研讨和云南野外考察，收到论文38篇，36人作报告。

1989年10月19日-24日，在北京召开了纪念北京猿人第一个头盖骨发现60周年古人类学国际学术讨论会暨中国古脊椎动物学会第三届学术年会，来自亚、欧、美三大洲的近三十名国外代表和国内代表近150人参加了此次盛会。共收到论文84篇，报告论文65篇，内容包括人类化石、旧石器文化、第四纪地质、第四纪哺乳动物、古人类生活环境和古人类遗址年代学研究等各个方面。部分论文辑为《人类学学报》专号。出版了吴汝康、吴新智、张森水主编的包括贾兰坡等18位专家撰写的《中国远古人类》专著。

1992年8月16日-22日，学会第4届学术年会与江苏省古生物学会在辽宁大连联合举办，来自全国20多个省、市、自治区的120多名代表参加了此次会议，他们主要来自科研、高校及文博等系统。会议共收到论文摘要80余篇，36位代表做了学术报告，涉及生物地层、古构造、古气候、古环境、生物演化和古生物学等。大会另一项重要内容是古脊椎动物学会的换届选举工作，选举产生由17人组成的第三届理事会。主任邱占祥，副主任何信禄、郑家坚，秘书长郑家坚（兼），副秘书长尤玉柱、欧阳辉。需得说明的是，“古脊椎动物学会”从第三届起将改为“古脊椎动物分会”，理事会改为委员会，仍为中国古生物学会下属的二级学会。为了便于联系，国外仍使用“中国古脊椎动物学会”，简称SVPC。 

1994年11月24日-12月1日，古脊椎动物分会第五届学术年会由学会和成都理工大学、重庆自然博物馆联合举办，在四川成都、自贡两地举行，来自全国16个省市包括科研、高等院校、博物馆和文管会等24个单位约85人参加了此次会议，提交会议论文近50篇，宣读论文32篇。论文内容主要以我国侏罗纪、白垩纪恐龙为重点，同时也兼顾了古脊椎动物其它门类、石器、新技术新方法和化石保护等方面的内容。会议期间代表们参观了成都市郊第四纪化石地点、侏罗纪恐龙产地、层型剖面以及自贡博物馆、重庆自然博物馆、恐龙博物馆。

1997年6月1日-4日，纪念杨钟健先生百年诞辰暨第六次古脊椎动物分会学术年会在北京举行。来自全国的150余位代表参加了会议，18位代表做了大会学术报告，内容几乎涉及脊椎动物学和古人类学研究的各个领域。本次大会选举产生由17人组成的第四届理事会，理事长叶捷，副理事长薛祥煦，秘书长董军社，副秘书长金昌柱、欧阳辉。 

1999年4月25日-30日，古脊椎动物学会（分会）第七届学术年会由学会和云南玉溪文化局联合举办，在被誉为“化石宝库”的云南省玉溪市举行，出席会议100多人，其中有日本京都大学濑户口烈教授等5位日本古生物学家以及台湾大学2名教授等。会议收到论文31篇，24位代表做了有关辽西地层、脊椎动物群与地层、中生代恐龙、新生代哺乳动物和旧石器考古等方面的学术报告。本届会议首次出版了会议论文集《第七届中国古脊椎动物学学术年会论文集》。会议期间代表们参观了澄江动物群化石产地和玉溪地区峨山恐龙化石地点。 

2001年11月2日-6日中国古脊椎动物学会（分会）第八届学术年会在深圳市仙湖植物园召开。出席会议120余位代表，澳大利亚、加拿大、日本和我国台湾地区学者参加了会议。刘东生院士、吴新智院士和澳大利亚Jim Bowler教授、加拿大Nat Ratter教授作了大会主题报告，介绍了鸟类起源的陆岛假说，人类起源问题的争论，环境变迁对人类演化的影响等。出版了《第八届中国古脊椎动物学学术年会论文集》。会议选举产生第五届理事会，由23人组成，理事长朱敏，副理事长李奎、王元青，秘书长金昌柱，常务副秘书长张翼，副秘书长欧阳辉。新成立三个专业委员会：古脊椎动物学专业委员会（主任委员周忠和）、古人类学与旧石器考古学专业委员会（主任委员高星，副主任委员刘武、石金鸣）和教育与科普专业委员会（主任委员李奎，副主任委员张和）。

2004年11月19日- 22日古脊椎动物学会第九次学术年会在广西南宁市召开，中国古生物学会古生态专业分会学术会议与本次年会联合召开。来自全国科研院所、高校和博物馆系统从事古脊椎动物学、古人类学及相关技术研究研究的代表近百人参加了本届年会。收到论文30余篇，21位代表作了大会学术报告，内容涉及古脊椎动物学、古人类学、生物地层学的各个研究领域。编辑出版了《第九届中国古脊椎动物学学术年会论文集》。

2006年11月20日-22日，中国古脊椎动物学会第十届学术年会暨第四纪古人类—旧石器考古专业委员会首届年会由学会和福建省文化厅、三明市人民政府共同主办，在福建省三明市召开。来自全国各科研院所、高校、文博系统、台湾以及法国、俄罗斯等单位170余人出席参加本次会议。本次大会收到论文40余篇，出版了《第十届中国古脊椎动物学学术年会论文集》。会议期间，共有35位代表在大会上作了学术报告。本次会议讨论通过了《古生物化石保护三明宣言》，呼吁全社会积极开展科学普及和宣传活动，大力提高政府和公民对古生物化石重要性的认识，提高全社会保护古生物化石的法律意识和自觉性，保护古生物化石，保护科学资源，保护珍贵的自然与文化遗产。会议选举产生第六届理事会，由26人组成，理事长朱敏，副理事长李奎、高星、欧阳辉，秘书长张翼，副秘书长王頠、郑龙亭。调整原有的三个专业委员会为学术委员会（主任委员高星，副主任委员张云翔）、科普委员会（主任委员欧阳辉，副主任委员王原）和教育委员会（主任委员李奎，副主任委员周忠和）。 

2008年9月20日-23日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所、中国古脊椎动物学会和山西博物院在山西省太原市联合举办古脊椎动物学会第11次学术年会和第四纪古人类—旧石器专业委员会第2次学术会议暨贾兰坡院士百年诞辰纪念会。这是中国古生物学会古脊椎动物学分会和中国第四纪古人类—旧石器专业委员会成立以来所举办的规模最盛大的一次学术会议，有来自全国科研院所、高校、文博系统70余家单位的近200名专家学者和相关代表参加。大会共收到论文71篇，内容包括了爬行动物演化、哺乳动物起源、人类体质特征、旧石器考古新进展、第四纪洞穴堆积、年代学等方面研究，在会前出版了会议论文集和贾兰坡院士纪念文集，有59位代表做了大会或分组学术报告。为鼓励青年学生学术交流，会议安排了研究生报告专场，首次设立了“研究生优秀报告奖”，由分会教育专业委员会组织相关专家评选，6位研究生获奖。会后代表们参观了西侯度、丁村等遗址和泥河湾盆地N/Q界线和层型剖面。

2010年9月13日-15日，古脊椎动物学会第12次年会暨第四纪古人类—旧石器考古专业委员会第3次会议在山东省平邑县召开。来自全国各科研院所、高校、文博系统等80多家单位190余位代表参加了会议。会议收到学术论文40余篇，其中29篇收入会议论文集，有43位代表作了学术报告，从不同角度展示了古脊椎动物学、古人类学、旧石器考古学、生物地层学、分子生物学、古环境学等学领域最新研究成果和进展。会议安排了研究生报告专场，由分会教育专业委员会组织相关专家进行了“研究生优秀报告奖”评选，2位研究生获奖。另外这次会议进行了换届选举工作，选举产生了由31人组成的第七届理事会，周忠和任理事长，高星、石金鸣、张云翔任副理事长，张翼任秘书长，王頠、郑龙亭、卢立伍任副秘书长。

2012年8月25日-27日，中国古生物学会古脊椎动物学分会第13次年会暨第四纪古人类—旧石器考古专业委员会第4次年会在内蒙古自治区二连浩特市召开。来自全国各科研院所、高校、文博系统等80多家单位200余代表参加了会议。本次大会会前收到论文33篇，出版了年会论文集；会间共有50余位代表作了学术报告。从不同角度展示了古脊椎动物学、古人类学、旧石器考古学、生物地层学、分子生物学、古环境学、化石资源的开发与保护等领域的最新研究成果和进展。本次年会继续开设研究生报告专场，并由教育专业委员会组织评委进行评选。近20名充满朝气和活力的年轻学子做了专场报告，最终有4位同学脱颖而出，荣获“研究生优秀报告奖”等殊荣。学会第七届理事会第2次会议也顺利召开,投票选举出贵州省黔西县人民政府为第14次年会的承办单位，举办地点为贵州黔西。

2014年4月18日至21日，中国古脊椎动物学会第14次学术年会、中国第四纪古人类—旧石器专业委员会第5次学术会议在贵州省黔西县顺利召开，会议由古脊椎所和毕节市人民政府联合主办，黔西县人民政府和毕节市文化体育广播影视电视局承办。来自全国各科研院所、高校、文博系统90多家单位的近300位代表参加会议。本次大会共安排76场学术报告，并出版论文集，收录37篇学术论文。论文和报告内容丰富，涉及内容广泛，从不同角度展示了古脊椎动物学、古人类学、旧石器考古学、生物地层学、分子生物学、第四纪测年、博物馆建设与科普传播等领域的最新研究成果和进展。20余名研究生参加了研究生报告专场，5位同学获得“研究生优秀报告奖”。本届年会首次设立“杨钟健科学传播奖”，李建军、王原、齐芳三人获得奖励。为表彰上海睿宏文化传播有限公司在学科科学传播方面做出的突出贡献，授予其“中国古脊椎动物学会科普创作基地”称号。本次年会，学会理事会完成了换届选举工作，召开了理事会和常务理事会会议。新一届理事会就未来两年的理事会工作，畅所欲言，深入交流和讨论，就科学传播奖的评选机制、会员制度的规范化管理、如何推动博物馆间联合活动、如何推动科学传播工作等展开广泛而深入地交流，并审议下一届年会的承办申请，最终确定由大庆市文化广电新闻出版局和大庆市博物馆联合承办。