一、课题组简介

课题组立足于我国百万年以来丰富的化石资源,通过共同创新和延展应用分子古生物学技术,从遗传学角度深入探索人类及其伴生物种的起源与演化历史,已经取得许多重要研究发现且在国际上具有广泛影响力。课题组也长期保持与古DNA研究领域国际前沿团队的交流合作,旨在共同推进全球分子古生物学研究的发展。

(一)主要研究方向:一方面通过延展或开发新的实验技术,不断提高古DNA数据质量和拓展材料来源,广泛开展各类考古遗存(骨骼、沉积物、牙结石等)的古DNA捕获与测序工作。另一方面通过运用生物信息学与群体遗传学分析方法,根据所获取的分子遗传学数据:(1)研究古老型人类基因特点,揭示古代人群的遗传结构,构建现代人起源与演化的框架、以及旧石器时代以来欧亚不同区域,尤其是东亚人群的起源、迁徙及互动交融情况;(2)古人群微生物演化,包括古代共生微生物及病原菌演化。通过古微生物基因组复原人类生存方式和健康状况的变迁,追溯古代疫病流行和共生微生物演化,解读人类与环境的互动关系;(3)在大尺度时空背景下,开展对珍稀以及驯化动物的古代群体特征、演化历史以及适应性进化等研究,来反映动物的进化、对环境的响应以及人群和动物的相互作用关系;(4)通过获取古蛋白质序列及其修饰信息,研究人类及动物演化和相关生理功能特点;利用古蛋白质的质谱分析技术对大量碎骨进行快速的动物种属鉴定,可从中筛选出古人类化石,构建更完备的遗址动物群,并进一步探讨古人类行为;对考古遗址中出土残留物进行蛋白质组分析,可探讨先民对动植物资源的多层次的应用。

(二)实验室成果:实验室团队共同开发的古核基因组捕获技术,显著拓宽了古DNA研究的时间尺度和地域跨度;破译世界最古老现代人的高质量基因组序列;绘制欧洲不同时期人群动态遗传历史;解码中国约四万年前最古老现代人“田园洞人”基因组;解锁东亚黑龙江流域、西南地区等地长时间尺度下古人群动态演变和适应性基因演化;大规模捕获南北方人群古基因组以揭秘万年来东亚族群演化历史;探究五千年来新疆不同区域人群在不同时间跨度下的遗传特点和交流历史;获取青藏高原“泥土”中的东亚首例丹尼索瓦人DNA;利用动物古基因组进行物种鉴定并探讨与古人类的相互作用关系;对DNA获取失败的10万年以来的斑鬣狗化石进行古蛋白质分析探讨其系统演化;系统评估古微生物标准实验方案相关污染物等。迄今在国际SCI期刊发表论文70余篇,其中在Nature、Science、Cell上发表30余篇,总影响因子超过1600,他引次数超过10,000,在国际上产生重大的学术影响。相关成果入选Nature“年度十大科学事件”、“中国科学十大进展”、“中国古生物学十大进展”、 国际“人类起源研究十大新认知”,登上《科技创新(三)》纪念特种邮票和参展国家“十三五”科技创新成就展等。因上述研究的重要性及对领域的突出贡献,受Science、Cell特刊邀请领衔古DNA领域发表研究综述和技术评述,且应Cell创刊五十周年专刊邀请撰文探讨“何以为人”的前沿科学问题,在国际领域内凸显出我国的科研实力和相关话语权。

二、暑期课程简介

(一)时间:2024年7月上旬(具体时间另行通知,课程持续一周) 

(二)地点:中国科学院古脊椎动物与古人类研究所(北京市西城区西直门外大街142号,北京动物园对面) 

(三)形式:线上/线下(视具体情况而定)

(四)课程内容:

来自全国各高校的优秀大学生将与付巧妹研究员课题组的老师及学生进行交流,通过专题讲座、互动讨论等形式,感受本课题组的研究氛围,初步了解分子古生物学领域的研究前沿和基本方法。同时促进师生之间的相互了解,为2024年接收免试推荐研究生(即2025年秋季入学的研究生)进行初步遴选工作。详细内容如下:

1. 课程讲授:

1)古DNA研究前沿进展;

2)世界人群遗传历史;

3)古微生物研究和古DNA实验技术;

4)群体遗传学方法与原理;

5)古蛋白质研究概述;

6)Linux系统操作基础。

2. 课题探究:以小课题的方式开展研讨活动,了解科研工作的流程和要点,激发主动探索的科研精神,同时进行小组汇报展示,提升汇报能力。

3. 文献研讨:阅读古DNA前沿研究成果,开展文献研讨会,分析解构文章逻辑,构建系统知识体系。 

4. 模拟实验:学习古DNA实验的严格要求与操作规程,理解实验室工作要点,开展模拟实验操作,锻炼实验操作能力。

5. 参观活动:参观分子古生物学实验室、中国古动物馆。 

(五)考核内容 

1. 个人能力(课堂表现、参与度、文献研讨等) ;

2. 团队合作(课题合作讨论与展示) ;

3. 实验操作(模拟实验操作) ;

4. 其它综合表现 。

(六)申请资格 

1. 生命科学、计算信息学、考古学、地质学等相关专业本科三年级学生(2021级); 

2. 学习成绩优秀,对科学研究有浓厚的兴趣,具有较强的科研潜力;

3. 英语水平优秀,需提供相关证明(本研究组为国际前沿科学团队,部分暑期课程为英文教学,要求参与者具有良好的英语沟通和阅读能力); 

4. 有意在本实验室深造者优先考虑。

(七)报名申请

1.报名材料 

1)填写报名申请表(附件下载),需本人签字; 

2)本科成绩单1份(须加盖院系或学校教务处公章); 

3)总成绩排名1份(须加盖院系或学校教务处公章); 

4)英语四、六级证书或其他英语考试的成绩证明1份; 

5)学术成果、获奖,及其它证明材料(非必须项);

2.网上报名

将以上1)~ 5)报名材料按顺序合并成一个PDF文件,以【学校+姓名】命名的附件形式发送至以下邮箱:<paleo-molecular@ivpp.ac.cn>。同时,扫描以下二维码填写调查问卷。

报名截止时间:2024年5月8日

3.咨询方式

QQ群:249947118

咨询联系:徐老师 15010981236

Email:paleo-molecular@ivpp.ac.cn

欢迎广大老师同学们参加,具体安排请关注QQ群消息。

(八)录取程序

本次暑期课程报名材料审核及资格审定工作由暑期课程评审小组负责,该工作于2024年5月18日以前结束,届时将通过邮件公布入选学员名单,并择优选择有意向的同学提前入组学习,请申请人关注邮件信息。

(九)费用说明 

本次暑期课程不收取授课费用,如采取线下形式,提供工作餐,同时给京外学员报销往返交通费(标准:学员学校或家庭所在地至北京的动车/高铁二等座、普通列车硬卧,报到时提供原始纸质票据)及提供课程期间的住宿(具体安排在报名结束后以邮件形式通知),其它费用自理。