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  • 姓名: 张驰
  • 性别: 男
  • 职称: 研究员
  • 职务: 
  • 学历: 博士
  • 电话: 010-88360750
  • 传真: 
  • 电子邮件: zhangchi@ivpp.ac.cn
  • 通讯地址: 北京市西直门外大街142号
    简  历:
  •   2002.9 – 2006.7,北京大学数学学院,统计学学士  

      2006.9 – 2012.7,中国科学院动物研究所,生态学博士(张德兴、杨子恒)  

      2010.10 – 2012.9,美国加州大学戴维斯分校,联合培养(Bruce Rannala  

      2012.11 – 2015.6,瑞典自然历史博物馆,博士后(Fredrik Ronquist  

      2015.9 – 2017.8,瑞士苏黎世联邦理工大学,博士后(Tanja Stadler  

      2017.9 – 2021.11,中国科学院古脊椎所,副研究员 

      2021.12 – 2022.11,中国科学院古脊椎所,青年研究员 

      2022.12 – 今,中国科学院古脊椎所,研究员 

    社会任职:
    研究方向:
  • 计算古生物学。通过建立统计模型,发展新算法,编写计算机程序,综合运用随机模拟和真实数据分析,探索一系列重要演化生物学问题的解决方案:包括系统发生关系重建、分化时间估计、演化速率和分异模式推断等。在理论方法、计算机模拟和真实数据分析方面都取得了创新性的研究成果。所用模型和算法独立或合作编写于本领域广泛应用的软件MrBayesBEAST 2中。

     

    软件:

    MrBayes (github.com/NBISweden/MrBayes)

    1. compound Dirichlet priors for branch lengths (Zhang et al. 2012)

    2. total-evidence dating under fossilized birth-death priors (Zhang et al. 2016)

    3. parsimony-guided tree proposals (Zhang et al. 2020)

    4. mixed independent gamma and lognormal relaxed clocks (Zhang. 2022)

     

    BEAST2 (github.com/CompEvol/beast2)

    1. SpeciesNetwork (github.com/zhangchicool/speciesnetwork, Zhang et al. 2018)

    2. BDSky (github.com/zhangchicool/bdsky, Zhang et al. 2023)

    承担科研项目情况:
    代表论著:
  • Y Yu, C Zhang*, X Xu*. 2023. Complex macroevolution of pterosaurs. Current Biology, 33 (4), 770-779 

    C Zhang. 2022. Selecting and averaging relaxed clock models in Bayesian tip dating of Mesozoic birds. Paleobiology, 48 (2), 340-352 

    Y Yu, C Zhang*, X Xu*. 2021. Deep time diversity and the early radiations of birds. Proceedings of the National Academy of Sciences USA, 118 (10), e2019865118 

    C Zhang, JP Huelsenbeck, F Ronquist*. 2020. Using Parsimony-Guided Tree Proposals to Accelerate Convergence in Bayesian Phylogenetic Inference. Systematic Biology, 69 (5), 1016-1032 

    A Gavryushkina#, C Zhang#. 2020. Total-Evidence Dating and the Fossilized Birth-Death Model, pp. 175-193 in The Molecular Evolutionary Clock (SYW Ho, editor). Springer Nature Switzerland  

    C Zhang*, M Wang. 2019. Bayesian tip dating reveals heterogeneous morphological clocks in Mesozoic birds. Royal Society Open Science, 6, 182062 

    C Zhang*, HA Ogilvie, AJ Drummond, T Stadler*. 2018. Bayesian Inference of Species Networks from Multilocus Sequence Data. Molecular Biology and Evolution, 35 (2), 504-517 

    C Zhang, T Stadler, S Klopfstein, TA Heath, F Ronquist*. 2016. Total-Evidence Dating under the Fossilized Birth-Death Process. Systematic Biology, 65(2), 228-249 

    (*corresponding author, #equal contribution) 

     

    Google Scholar: scholar.google.com/citations?user=4othtCUAAAAJ 

    获奖及荣誉:
  • 2021. 张驰、余逸伦、徐星,生物多样性演化的方法探讨和鸟类演化实证研究, 古脊椎所重大成果 

    2021. 毛方圆、张驰,哺乳形动物的挖掘趋同演化与脊柱的演化发育意义, 中国古生物学十大进展与古脊椎所重大成果 

    2019. 倪喜军、李强、张驰,高原隆升背景下的灵长类演化模式研究, 古脊椎所优秀成果 

    2012. 中国科学院院长优秀奖,优秀毕业生,优秀博士学位论文